在人类日常生活当中存在着多种细菌，而厌氧菌就是其中之一。厌氧菌是一种在无氧条件下也能够进行繁殖的菌种，其在无氧条件下比在有氧环境中会生长得更好，然而却不能在空气(18%氧气)和(或)10%二氧化碳浓度下的固体培养基表面生长的细菌。
从临床角度上讲，厌氧菌可分为有芽孢的梭菌属，以及没有芽孢的杆菌和球菌。有芽孢的梭菌，包括破伤风梭菌、艰难梭菌、肉毒梭菌、产气荚膜菌，其中破伤风梭菌是引起破伤风的主要原因之一。厌氧菌的能量代谢一般是以无氧发酵的方式进行，这主要是由于这类细菌本身缺乏完整的代谢酶体系。因此，厌氧菌在进入人体后，往往还能引起机体不同部位的感染，例如口腔感染、阑尾炎、胆囊炎、中耳炎、心内膜炎、子宫内膜炎、脑脓肿、肠道手术后伤口感染、盆腔炎以及菌血症等。
在临床当中，主要通过庞通巯基乙酸脂培养基这类医疗器械进行厌氧菌培养，而出于实用的目的，厌氧菌大体可分为三类：分别为专性厌氧菌、兼性厌氧菌以及耐氧厌氧菌。专性厌氧菌会因氧气的存在而受到伤害。例如梭菌和生活在深海海底热液喷口附近的细菌。兼性厌氧菌是指它可以在没有氧气的情况下生长，但如果有氧气，它就会使用氧气来保证基本的生存。而耐氧厌氧菌则是不能使用氧气进行繁殖生长，但却可以在氧气中存活，接受氧气的存在。
对于厌氧菌感染的治疗，目前对于体表感染且伴有脓液的患者，需通过开放创口，将其中的脓液引流出，在对局部使用双氧水擦拭消毒，利用生理盐水或蒸馏水冲洗，再用碘伏等药物来保证创口不受感染。而对于体内感染的患者，大多会有较为明显的炎症感染反应，此时需通过输注抗生素来进行治疗，医生会通过截取部分患者分泌物进行细菌培养和药敏，根据结果选择适合的抗生素，临床常用的抗生素有甲硝唑类、氨基糖甙类等，通过积极治疗后，大多数患者都可恢复正常生活。